NCI-MATCH新一代測序技術推進癌症個性化治療

生物通報道：來自美國德克薩斯大學MD安德森癌症中心生物庫和病理研究中心的P. Mickey Williams教授及其同事發表了一篇最新的文章，文章結果表明使用NCI-MATCH新一代測序法檢測腫瘤基因突變結果靈敏，特異性和重複性良好。

精準醫學的個體化治療是最有希望攻克癌症研究領域之一。美國國家癌症研究中心的分子分析治療選擇項目（NCL-MATCH）是一個正在進行中的、有關腫瘤基因特徵的大型腫瘤治療方法臨床試驗項目。這項測試研究內容不僅包括了提高多組織間的治療效力，而且針對兩種方法，大範圍篩選板（screening panels）和疾病特異性檢測（disease-specific assays）提供了臨床價值評估數據。來自美國德克薩斯大學MD安德森癌症中心的文章首先證實了NCL-MATCH中使用的檢測方法對多種腫瘤組織的基因突變非常敏感。其結果又被多家臨床實驗室重複實驗證實，為將來的臨床應用奠定了基礎。

到目前為止，下一代測序技術（NGS）的關注者們已經廣泛表達了NGS在臨床應用中的複雜性、準確性和可重複性等問題。多家臨床實驗室的重複試驗結果清楚地表明，標準化的操作程序將會是保障NGS能夠可靠、準確以及可被重複檢驗地應用於臨床的保障。

NCL-MATCH試驗將評估大約6000名患者的活檢標本。文章中使用的新技術，Oncomine Cancer Panel檢測和賽默飛世爾科技的個性化基因組檢測儀器，將檢測超過4000個預定義的橫跨143個基因的染色體組突變型，包括單鹼基變異（SNV），插入/缺失（indels），拷貝數變異（CNVs），和基因融合等。臨床證據水平分級將被開發用於選擇與治療匹配的特定的可控基因突變子集。

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研究人員報告說，該試驗是高度敏感的（已知的265個突變的檢出率為96.98%），並且具備了99.99%的特異性。由於NCL-MATCH試驗是廣泛品種的腫瘤檢測，包括了對標準治療無應答的實體瘤和淋巴瘤，這就要求對於來自不同組織的標本都能夠通過該檢測手段。其意義重大的是，NCI-MATCH中所用到的NGS檢測能夠準確地鑒定來自活檢胰腺、黑色素瘤、骨頭和皮膚樣品中的遺傳異常。

四個實驗室分別對186個樣本以及12株細胞系進行了測試。所有實驗步驟都最大限度地提高了標準化操作，包括制定標準的操作程序，使用相同的商業分析和儀器，並面對面的集體討論。研究人員發現，檢測結果是高度可重複的，即四個實驗室的結果完全一致。高重複性實驗結果對未來的臨床應用至關重要，尤其是用以改善患者的預后。

來自亞特蘭大市疾控中心的Elizabeth R. Unger醫學及理學博士，一直從事高致病菌和病理學研究，她認為，P. Mickey Williams教授和他的同事們的據實報道是精準醫學改善臨床結果的又一個里程碑。儘管，我們目前還無法100%地保證NCL-MATCH試驗一定會取得成功，但是它將精準實驗室和精準醫學檢測真正聯繫起來，這為意味著將來的藥物準確分配將會得到保障。此外，今後的商業平台和綜合分析利用其報告渠道將會大大促進這項研究成功轉化。

（生物通：盧兆丹）

原文標題：

Analytical Validation of the Next Generation Sequencing Assay for a Nationwide Signal Finding Clinical Trial: Molecular Analysis for Therapy Choice Clinical Trial (NCI-MATCH, EAY131), The Journal of Molecular Diagnostics, volume 19, issue 2 (March 2017)