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一個偶然的機會，在家觀看央視紀錄片頻道播出的《宇宙的起源》系列紀錄片，發現其描述的人類目前所了解和認識的宇宙起源科學知識，與南師在講解佛學、唯識學等有關宇宙方面的知識，有異曲同工之妙。這也印證了南師經常強調的「佛法是超科學、超宗教的」，「現代科學已經證明的，佛學都有表述；而佛學所闡釋的，現代科學尚未完全證明，不能就認為是不科學或是迷信的」。人從哪裡來，人往哪裡去?這些貌似簡單的現象背後，其實蘊含著豐富的人生哲理和智慧。南師用他過來人的真修實證、融會貫通的百家學問和獨特精闢的人生見解，用淺顯生動的語言加以闡釋，用心之專、用功之深，無出其右。南師的晚年，特別注重唯識學和生命科學的研究。他所創立的太湖大學堂，也與國內外一些大學和科研機構建立了聯繫與合作。​這方面，受影響和啟發較大的，當數原中科大校長朱清時院士，他因為自己的一篇物理學文章遇到了困擾，后受南師講課的啟發，寫出了《物理學步入禪境》的論文，廣獲好評。同時，朱院士也領受了南師交給他的一個任務：用他所掌握的科學知識，從科學家的視角，把佛法中的超越科學的見解證明併科普化。無論有神論者還是無神論者，尊重實證的研究態度是不會錯的。《說不盡的南懷瑾》