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上海市兒童醫院內分泌科成立於1980年是國內較早開展小兒內分泌診療單位之一。現年門診數50000餘人次，住院病人1800餘人次。小兒內分泌疾病如兒童性發育異常（性早熟性發育不良兩性畸形）糖尿病矮小症甲狀腺疾病腎上腺疾病肥胖症及尿崩症等疾病的診治水平國內領先。中藥復方地黃合劑及復方逍遙合劑治療性早熟為科室特色，臨床療效顯著，深受好評。近年來，科室基礎研究向臨床轉化方面取得了巨大進步，使得大部分內分泌遺傳代謝病能夠得到精準診斷。通過多學科協作，強強聯合，性發育異常患兒的精準診斷個體化治療水平居全國前列，性腺發育障礙患者就診人數居上海首位。科室目前有高級職稱4名，其中博士研究所導師1名，中級職稱5名，初級職稱4名，共培養畢業碩士研究所15名。1人獲得上海交通大學醫學院優秀青年人才稱號，2人入選兒童醫院優秀青年人才培養計劃。