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由於日本古代吸收了很多來自的文化，加上古書中也有關於人東渡日本的記載（徐福東渡），於是就有很多人懷疑日本人是人的後裔。然而，關於日本人的血統問題一直是日本歷史學的一段公案，至今無解。因為日本早期歷史記載一度是個空白。現在研究者把日本民族的起源歸於以下幾個版本：（1）來自東北通古司的騎馬民族；（2）來自稻作文化發達的江南；（3）來自阿拉伯文明；（4）來自雲南，因為歷史上這兩個民族都有「黑齒」的習俗；此外，還有東南亞、蒙古高原等說法。有人分析，日本人的祖先的確應該有血統，但是在幾千年的時間裡，日本通過不斷吸收外來文化，最終形成了一個多族雜交的日本民族。日本教授認為他們的史書記載日本人與秦始皇有淵源，很可能自己是秦始皇之孫考武王的後裔。然而國內很多專家對此卻不屑一顧，認為日本屬於「雜交文化」，我們不接受這樣的子孫！