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2017-07-25T20:27:27+00:00
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近期,來自英國牛津、華大基因以及美國相關機構的研究人員,在國際學術權威刊物 NATURE 出版集團旗下子刊《Scientific Data》雜誌發表了題為「11,670 whole-genome sequences representative of the Han Chinese population from the CONVERGE project」的文章。在這項研究中,研究人員使用重度抑鬱症(MDD)CONVERGE(China, Oxford, and Virginia Commonwealth University Experimental Research on Genetic Epidemiology)聯盟中 11670 名漢族女性的全基因組測序數據(低覆蓋度)。這些樣本來自 23 個省 58 家醫院,構成了全世界最大的種族全基因組測序資源。基於這些數據,一共得到了 2 千多萬個高質量的基因組 SNP 位點,目前為止是東亞人群最大的 SNP 數據集。基於這些人群 SNP 變異信息,可以成功開展對於重度抑鬱症的全基因組關聯分析。此外,結合其他群體的數據,還可以進行進化遺傳學等方面的研究。 此前,來自英國牛津大學、台灣長庚大學、華大基因和美國弗吉尼亞聯邦大學的研究人員,在 Cell 子刊《Current Biology》發表題為「Genetic Control over mtDNA and Its Relationship to Major Depressive Disorder」的成果。研究發現,線粒體 DNA(mtDNA)的數量會發生改變,以響應外部壓力:與對照組相比,重度抑鬱者的唾液和血液中有顯著更多的 mtDNA。在這項研究中,研究人員基於 10442 名漢族女性的低覆蓋度全基因組測序數據,對 mtDNA 水平進行了第一個全基因組關聯研究(GWAS),以探尋什麼可能參與了調控 mtDNA 水平的分子通路。研究人員計算了映射到線粒體基因組中的標準讀取數,作為 mtDNA 數量的一個衡量。該研究中確定了有助於 mtDNA 水平的兩個位點:一個是在 TFAM 基因中,一個是在 CDK6 基因中。這兩個位點是在一個獨立的陣列中複製的。因此,CDK6 是參與控制 mtDNA 的一個新分子。研究人員確定了 MDD 女性中異質性的增長率,利用小鼠模型從一個實驗範式中發現,這種增加可能是因為壓力。此外,該研究發現,至少有一個異質性變異與 mtDNA 數量的變化顯著相關,從而表明位點特異性的異質性可能是壓力和 mtDNA 數量增加之間的一個關聯。這些結果指出,線粒體基因組拷貝數和序列,參與了機體對壓力的響應。 參考文獻: 11,670 whole-genome sequences representative of the Han Chinese population from the CONVERGE project. Sci Data. 2017; 4: 170011. "Genetic Control over mtDNA and Its Relationship to Major Depressive Disorder" in Curr Biol, volume 25 on page 3170. ),定時推送,福利互動精彩多

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