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1953年7月7日，內蒙古自治區蒙文專科學校在歸綏市（今呼和浩特）成立，是內蒙古自治區成立之後黨和國家在內蒙古地區成立最早的高校之一，也是蒙古民族發展史上的第一所高等學府。呼和浩特民族學院是經國家教育部批准設立，由內蒙古自治區人民政府主辦的全日制綜合性普通大學部高等院校。學院的前身就是內蒙古蒙文專科學校。內蒙古蒙文專科學校成立時，內蒙古自治區除了剛剛成立的內蒙古師範學院和內蒙古農牧學院以外，還沒有建立其它高等院校。內蒙古蒙文專科學校從成立之日起就確立了鮮明的民族特色和地區特色，並在內蒙古自治區高等教育發展史上佔據了極其特殊的地位，發揮了重要作用。2000年，經國家教育部和自治區人民政府批准，內蒙古蒙文專科學校、內蒙古民族師範學校合併組建內蒙古民族高等專科學校；2009年內蒙古民族高等專科學校升格為呼和浩特民族學院。