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改變人類的科學計劃,讓你迅速窺見自己的「前世今生」

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先考大家一個問題:還記得國中時歷史、生物、物理課中都介紹過的20世紀影響人類進程的三大科學計劃是哪三大計劃嗎?

(唔,假裝思考……)

沒錯,曼哈頓原子彈計劃、阿波羅登月計劃和人類基因組計劃,被稱為影響人類進程的三大科學計劃。其中,曼哈頓原子彈計劃、登月計劃早已實現。2005年,人類基因組計劃這項旨在測定組成人類基因組的30億對鹼基對(鹼基對是基因的最小組成單位),繪製人類基因組圖譜,達到破譯人類遺傳信息最終目的的科學探索巨型工程,終於基本完成。

姿勢點

Take Away

之所以稱之為「影響人類進程」的三大科學計劃。原因在於:1. 在當時社會條件下佔用了巨大的人力財力,甚至舉國之力;2. 取得了劃時代結果,直接突破人類對自然科學領域現有認知水平;3. 影響到全人類的科學和社會進程。

正是得益於人類基因組計劃,奠定了基因測序技術接下來十幾年突飛猛進的發展,在全球範圍內催生出一大批生物醫療領域的創業項目。

近日,一家來自矽谷的基因測序初創公司,在創投圈非常火熱,叫做 Paragon Genomics,不僅被選入美國加州生命科學協會 2016 年春季全明星創業團隊項目,還剛超額完成 800 萬美元的 A 輪融資。斯坦福大學、加州大學舊金山分校、中科院北京基因組所、安諾優達以及幾十家大型第三方檢測實驗室,都是 Paragon Genomics 旗下的重量級客戶。

到底這家公司的技術有何先進和獨特之處?耳聰目明的密探醬,趕緊約了採訪,希望通過這家公司,了解到基因測序技術的意義和應用前景,以及對人類生活帶來的改變。

創業第一桶金成為哈佛學費

Paragon Genomics 的聯合創始人和 CEO 是一位華人,名叫諶濤(chén tāo)。1997 年,諶濤考入北京大學化學系,后赴美攻讀化學醫療交叉領域的碩士。畢業后,他在全球最大的製藥公司——輝瑞製藥工作了五年,進行癌症相關藥物研發工作。

雖一直從事嚴謹的研究工作,諶濤卻早在剛來美國讀書時,利用兼職創業,挖下人生第一桶金。

說來有趣,當時國內學生考 GRE 和托福,一般兩個月可以上網查成績。但其實,考完一個月,考生就能付費電話查詢了。但是一來大部分人沒有美國可用的信用卡,二來國際長途不是那麼好打,於是諶濤在幫同學打了兩次電話后敏銳地發現:這是個現成的商機啊!

基於這樣的業務,他這家小小的初創公司生意不錯,諶濤也只需要周末時間就能完成,並且攢下人生第一桶金——雖然數額不多,卻足夠囊括去哈佛大學讀一個 MBA 學位的開支了。這給他搭起了通往更高領域的台階。

抱著創業目標,去了哈佛,選擇的也多是和醫療創業相關的課程(感嘆一下哈佛商學院對「創業」的課程細分度)。畢業后,他又去了著名的LifeTechnologies,擔任企業戰略及發展、公司併購等部門的領導職位,並在此遇到了自己的聯合創始人、公司核心技術 CleanPlex 的發明者,現任公司首席技術官的劉至東博士。

CTO 劉至東(左)和 CEO 諶濤(右)

基因測序,奠定「精準醫療」基礎

那麼,到底 Paragon Genomics 在做的是什麼呢?作為對生物醫療領域完全的外行人士,小探已經搞懂了!接下來就努力給大家解釋一番,精準醫療、基因測序這些聽著先進抽象的名詞,以及Paragon Genomics在行業中的地位。

在人類基因組計劃沒有完成之前,給一個人做基因測序,可能要耗上數十萬美元。但是,人類基因組計劃 2005 年初步完成目標后,基因測序的成本急速下降——現在已經能控制在 1000 美元,這個速度比半導體行業的摩爾定律都快

現在,國內外都有針對個人消費者的基因測序服務,花費從數百元到數萬元不等,你就可以從基因層面,對自己身體的「前世今生」有更深刻更全面的了解。但基因測序對醫療行業的一個更為深刻的影響,就是奠定了「精準醫療」的基礎。

2015年,歐巴馬總統在國情咨文中提出「精準醫學計劃」;2016年將「精準醫學」納入國家重點研發專項,讓這一名詞迅速火爆起來。

我們拋開複雜的定義辭彙,精準醫療,就是指根據個體的基因區別,對症下藥,找到對病人個體最佳的治療方式。所以,和基因相關的疾病,普遍適用這種方法,其中被討論最多的,就是癌症。

癌症主要是由於 DNA 上的基因突變引起。舉個例子,有多種突變都可能引發肺癌,比如 EGFR 這個基因的第19號外顯子片段缺失,是引發肺癌的常見突變之一。一些治療藥物是針對這種特定突變研發的,所以在用藥之前,就要先通過基因測序的方式,找出病人是哪種基因突變致病,才能更精準地選擇藥物。

那麼,人體有 30 億對鹼基對,我們在對病人進行基因測序時,當然沒必要全部測完,只需要選擇測序那些有意義的、和疾病相關的部分(可能遠不到總量的1%),是謂「靶向測序」——這也是基因測序領域的主流。而靶向測序又可以分為三個步驟:文庫/樣本製備、測序和數據分析。

樣本製備,不再是「海中垂釣」

Paragon Genomics 的技術,正是針對靶向測序的最前端步驟:樣本製備。想必聰明的讀者們已經猜到:樣本製備,其實就是要從浩如煙海的人類基因中,把需要的部分抓取/擴增出來。

到底 Paragon Genomics 在樣本製備領域有何獨到創新之處?這就要說到此前樣本製備方法存在的明顯的缺點了——沒錯,以往樣本製備,採用的是「海中釣魚」式方法,時間久(2到3天完成一次樣本製備),成本高(需要50-100美元)。

為什麼把樣本製備比喻為「海中釣魚」?我們人體鹼基對由A、T、G、C組成,其中A和T互補,G和C互補。舉個例子,如果你想抓到一個 ATGC 鹼基對,就用 TACG 鹼基對去吸引它。所以,此前的方法就是先把基因組打碎為 100 到 200 鹼基對的小片段,然後用一枚 120 個鹼基的探針,去吸引自己想要的片段。這枚探針在鹼基片段中要長時間尋尋覓覓,才可能發現自己的「另一半」,並且還可能「釣」出來錯誤的片段。

鹼基對示意圖

而 Paragon Genomics 則摒棄了「釣魚」,採取「複製」的方法。公司核心技術CleanPlex,簡要概括就是:運用 PCR 方法,用一對「引物」將想要的基因片段定位,然後利用生物酶將其複製/擴增出來,該過程可以重複十數次,將想要的基因片段複製出上千到上萬份,其信號強度大大增強。

我們來逐個解釋裡面的名詞。首先什麼叫 PCR ?這是一種分子生物學技術,中文名聚合酶鏈式反應。名詞看不懂沒關係,該技術能做的事情就是:在生物體外,將特定的 DNA 片段大幅擴增。其次,「引物」是什麼?——引物是成對出現的,是一種定位工具,能定位實驗者想要的基因片段。一旦想要的基因片段被引物定位,它就能通過 PCR 方法被反覆複製。

Paragon Genomics 獨家之處還在於:他們的技術可以同時在試管里使用成千上萬對引物,從而同時定位並且複製成千上萬個基因區域。這是一件極其困難的事情,世界上能做到的生物醫療公司不超過3家,Paragon Gemonics 是其中一家。

技術部分解釋完畢,其先進性體現在現實中,能帶來以下好處:首先,大大縮短了樣本製備的時間——只需要兩個半小時,基本是行業內最高技術水平;與之對比,傳統方法需要 36 小時;此外,成本只有傳統方法的一半;其次,能擴增傳統方法極難擴增的區域,比如癌症中常見的 TERT Promoter 突變區域;最後,要求的樣本量較低(1-10ng),這一點在樣本量少的情況下極為重要和必需。

為客戶提供定製服務

目前 Paragon Genomics 已經有 50 多個大中小型機構客戶,諶濤告訴密探,他們希望為學校、科研機構和第三方檢驗所等,提供更快、更精準的二代靶向測序文庫製備技術和產品。

更通俗地說,就是 Paragon Genomics 為客戶提供定製服務,客戶把靶向測序的清單提供給我們,其它的我們搞定,最後呈現給你完整的報告。這個市場預計到 2020 年會超過百億美金;如果加上遺傳病檢測、個體化用藥指導等應用領域,那麼市場規模在千億美金級別。

姿勢點

Take Away

目前,基因組學應用的全產業鏈條為:上游是測序儀器、設備和試劑供應商;中游為基因測序與檢測服務提供商;下游為使用者,包括醫療機構、科研機構、製藥公司和受檢者。

由此可知,Paragon Genomics 恰好屬於「中游」,屬於承上啟下的地位。新成立的創業公司,應該首先找准自己的定位,如果一家公司能向全產業鏈延伸,其市場地位會更加無可撼動。

隨著人類基因測序工作的基本完成,這給生物醫療行業準備好了巨大的畫板和充沛的原材料。各種具體的應用想法,都可能促成一家明星創業公司。生物醫療領域,確實迎來了自己的利好時期。



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