美國發布艾倫幹細胞瀏覽器!含6000張幹細胞3D圖片

2017/04/10

想象一下,你有一雙特殊的「透視眼」,能夠透過一個人,看清楚他的每一個細胞、幹細胞,就好像在博物館看「裝在生物容器里的標本」。

這是美國艾倫細胞科學研究所努力在做的事情。他們歷時一年,製作出來自同一母細胞的不同幹細胞3D圖片集,形成了一個堪稱宏大的幹細胞圖片展覽,還帶有檢索功能,並命名為——「艾倫幹細胞瀏覽器」(Allen Cell Explorer),2天前才剛剛正式發布。

細胞是生命的基本單位。

我們體內的每個細胞都是一個微觀的小世界,包含著許許多多複雜的、鮮活的、相互合作、密切配合的「動力機制」,然後便促成了細胞的行為——比如說,類似於在你的體內遊走遊走,或者分裂一下、一個變倆,這樣的基礎行為也有比如說一大堆細胞約好了一起跳一跳,好讓你的心臟能夠完成泵血的這種高度專業化的行為。

生物科技前沿現在已經了解了究竟有多少這樣的「細胞動力機制」,但我們還沒有搞清楚的是,它們到底是怎麼完成一系列複雜的合作,在各種特定的時刻,完成各種各樣特定的任務的。理解這些非常關鍵,會幫助我們更好地看懂當一個人生病的時候,他的細胞究竟發生了什麼事情而導致無法正常運轉。

艾倫幹細胞瀏覽器提供的這些公開圖片集——Dr.博逛了逛,每一個細胞都超美,合在一起,堪稱震撼。它對細胞層面的研究會有很大的幫助,科學家們可以觀察癌症和其他疾病有關的細胞結構變化,從而加速幹細胞、癌症及藥物開發的研究進程。

艾倫幹細胞瀏覽器包含了6000多張誘導多能幹細胞圖片,每張圖片內DNA、細胞膜和線粒體等重要結構都用不同顏色標記。

《自然》雜誌網站報道了艾倫幹細胞瀏覽器的發布。艾倫細胞科學研究所主任瑞克·哈維茲帶領的研究團隊里,有計算機科學家利用程序對數千張圖片進行了分析,找到了不同細胞結構之間的相互關聯。深度學習程序能夠通過一兩點線索推測出細胞的結構信息,並將這些信息與真實細胞信息進行比較,不斷學習進步,從而演變成準確預測與疾病有關基因變異的3D交互工具。

資料來源:

http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2017-04/07/content_366742.htm?div=-1

博雅幹細胞綜合整理

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