GeneMail周報 | 第一條轉基因三文魚上餐桌、超級細菌DNA測序預測病人生存期

1、CDC投2.01億美元用基因組測序預防傳染病

美國疾病預防控制中心（CDC）4日宣布，已經申請了項目款2.01億美元，用於幫助州政府及地方政府使用基因組學和其他技術應對傳染病威脅。這筆資金將促進國家衛生實驗室對食物和水細菌進行全基因組測序，幫助國家和城市加強抵抗抗生素的能力。

參考：https://www.genomeweb.com/molecular-diagnostics/cdc-awards-201m-programs-combating-infectious-disease-threats

[十一郎淺談] 因為細菌病毒等病原體和藥物同步進化，抗生素耐葯問題由來已久。CDC的這項研究通過對食物和水的細菌的基因進行測序、生物信息分析，從數據角度更快速地識別和應對病原。感染病監測，也是基因大健康產業的重要應用模塊之一 。

2、NIH頒給臨床基因組學聯盟1890萬美元基金

美國國家衛生研究院今天宣布，已向7家研究機構頒發了1890萬美元的資金，這些研究機構將作為一個聯盟來推動在診所使用基因組學。該組織被稱為臨床測序證據生成研究（CSER2）聯盟，在2010年由國家人類基因組研究所（NHGRI）和國家癌症研究所（NCI）成立，用於探索在臨床護理中使用基因組測序技術。

參考：

【十一郎淺談】獎金數額總體不高，但對於這個聯盟，由國立基因組研究和國立癌症研究機構聯合成立，其中的思路值得國內借鑒。整合、應用等從頂層設計事半功倍。

3、亞馬遜秘密的互聯醫療實驗室「1492」

7月末CNBC發表文章稱，亞馬遜已經創建了一個專註於互聯網醫療技術的秘密實驗室 「1492」。積極探索EHR和遠程醫療技術。在對數字醫療初創公司投資方面，今年初亞馬遜投資了Illumina旗下的癌症早期篩查公司Grail。Grai今年3月的B輪融資是今年上半年數字醫療領域最大的一筆投融資交易，高達9億美元。

參考：https://www.cnbc.com/2017/07/26/amazon-1492-secret-health-tech-project.html

【十一郎淺談】亞馬遜的動作相對而言有些慢，蘋果、谷歌、三星、IBM、微軟等均已開發相應的雲平台等IT基礎設施或設立相應部門布局數字醫療。特別是IBM的Watson在視為座上賓。而微軟的醫學影像識別早在三年前，由微軟亞洲研究院的團隊從腦腫瘤病理切片的識別開始。數字醫療，一是影像數字化；二是基因等分子層面大數據。回歸到數據本身，存儲、傳輸、計算、分析、共享，下游的應用則是IT巨頭的強項。BT+IT不分家，亦敵亦友，優勢互補在於技術互通。目前尚未出現獨角獸。

4、第一條轉基因三文魚已經抵達加拿大餐桌

轉基因三文魚日前已被允許在加拿大出售。而這批三文魚的提供商AquaBounty Technologies是一家在馬薩諸塞州梅納德開發魚類的公司，該公司宣布已經向加拿大客戶出售了約4.5噸產品。此次銷售是全球內第一次在公開市場上銷售一種轉基因動物食品。AquaBounty表示為了這一天，已經努力了超過25年。

【十一郎淺談】轉基因是一種技術，如同基因基因檢測一樣，新穎而突破傳統，不能神奇化，也不能妖魔化。在經過驗證后即可採用，發現問題然後優化。不多說，說多會被小崔請去喝茶。看效果。

5、盧煜明教授用液體活檢篩查鼻咽癌

近日， 香港科技大學盧煜明教授帶領團隊在新英格蘭醫學雜誌上發表了一篇有關鼻咽癌DNA檢測的研究成果。該研究由亞洲基金會和香港政府贊助。盧教授通過液體活檢技術篩查了約20,000名男性，篩查出攜帶病毒DNA 的1112人，佔5.5％，其中309人還在一個月後就進行了DNA篩查檢測，最後通過內鏡和MRI確認后，34人出現癌症。本次篩查出的患者中，71%是癌症初期，20%是五年內接受過鼻咽癌治療的，這證明了液體活檢對於早期發現癌症的作用。盧煜明教授表示：「這是一個可以拯救生命的進步」。

參考：https://medicalxpress.com/news/2017-08-boosts-liquid-biopsies-cancer-screening.html

[十一郎淺談] 近期關於消費者基因檢測的產業熱點層出不窮，當部分人問結果有什麼用時？這個問題和當初人們當初認為癌症基因檢測得出的一個百分數概率有什麼意義的本質一樣。基因數據本質是輔助診斷，且在無表型癥狀時較傳統方法把診斷時間節點提前。在臨床上，用於遺傳病、腫瘤等診斷、用藥和預后評估等；在非臨床上，對於祖源分析、親緣關係、藥物敏感性等。不同需求，不同技術要求和渠道模式等。說回到癌症液體活檢，主要解決了活檢的取樣困難，而且對追溯癌症轉移和發現複發相對更準確。關於鼻咽癌的液體活檢研究很早，鼻咽癌是一種侵襲性癌症，多數情況和EB病毒有關，因此早期檢測更重要。盧教授這次成果，超過97%姣好數字使得被最權威的醫學雜誌收錄。

6、圖像分析工具預測乳腺癌未來複發

英國癌症研究所（ICR）的科學家已經開發了一種計算機圖像分析工具，可以預測雌激素受體陽性（ER +）婦女在10年內乳腺癌複發的可能性。圖像分析系統用於在常規採集的腫瘤樣本中查找腫瘤浸潤淋巴細胞（TIL）簇或「熱點」，這些簇或「熱點」無法輕易地被顯微鏡檢測到。

[十一郎淺談] 這個媒體比較客觀，如果換做創業和資本熱潮湧動的本土，這篇新聞極有可能冠以人工智慧的概念。當然，這樣的計算機分析工具，在對特徵向量和特徵值做好數據提取后，建立機器學習的模型是必然的。只是科學家、產業界和媒體需要面對人工智慧初級階段的現狀，加以對合作、驗證和優化的耐心。

7、超級細菌DNA測序預測病人生存期

巴斯大學米爾納進化中心研究人員開發了一種技術，可以通過對超級細菌DNA測序來準確預測個體應對耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）的生存機會。科學家研究了300例敗血病患者的血液樣本，檢查了不同MRSA菌株的表現並評估了它們的致死率。

參考：https://www.genomeweb.com/infectious-disease/mrsa-dna-sequencing-predicts-patient-survival

[十一郎淺談] 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌，感染后可使用青霉素控制。但隨著青霉素的廣泛使用，產生耐藥性。對細菌進行DNA測序，文中方法核心是主要鑒定影響細菌溶細胞毒性和生物膜信息表達的幾個遺傳基因座，將真實人群的信息與引起感染的細菌的表型和DNA序列數據相結合，創建一個預測模型，以便能夠準確預測個體存活MRSA感染的機會。這是未來基因數據與機器學習等新技術的結合點，不完全依賴已知資料庫，通過建模和模式識別進行非監督式學習和決策。

8、水果與腸道微生物相互作用或預防流感

許多水果和蔬菜中含有的黃酮類化合物與腸道微生物相互作用或可以預防嚴重的流感感染。研究人員發現，無論我們喝多少紅茶或紅酒，或者吞下多少藍莓，單憑豐富的黃酮類飲食本身可能無法提供預防保護。黃酮類化合物需要被指定腸道微生物代謝后，由這種微生物釋放類黃酮衍生物質進入血液中才能對免疫系統有所增強。

[十一郎淺談] ：昨日GeneMail整理了腸道菌群代謝黃酮類化合物產生的氨基酸能預防流感，那麼對於含有的黃酮類化合物的水果和蔬菜，可以讓吃（饞）貨（師）們大快朵頤同時安全可靠地預防疾病了~

9、阿爾茲海默氏病元兇或是大腦抗菌鬥士

1984年，科學家在阿爾茲海默病患者大腦中發現了β澱粉樣蛋白，並在隨後的系列研究中，認定大腦內部的β澱粉樣蛋白是阿爾茲海默病的病因。2010年，Moir和Tanzi博士驚奇地發現β澱粉樣蛋白可以抑制8種臨床常見病原菌的生長，且殺菌效果與青霉素相當。並經過五年研究后在2016年進一步證明，β澱粉樣蛋白是一種抗菌肽，可以有效防止線蟲、小鼠和人類神經元組織感染真菌和細菌。

參考：https://www.forbes.com/sites/robinseatonjefferson/2017/07/28/mapping-the-brains-microbiome-can-studying-germs-in-the-brain-lead-to-a-cure-for-alzheimers/#17b7460350da

【十一郎淺談】科學在被證明正確之前，也有可能是迷信。想想「地心說」。存疑，不盲從是創新的源泉。科研、創業和投資都是如此。積累知識儲備，提升判斷力是硬道理，基因慧正在助力幫您做這些知識助理的工作。

10、軟銀11億美元巨額投資生物製藥公司

今天， 生物製藥公司Roivant宣布獲得了 11 億美元的巨額投資，軟銀願景基金（Soft Bank VisionFund）領投。這筆巨額投資將成為有史以來規模最大的單筆生物科技領域投資。該公司 CEO Vivek Ramaswamy稱，Roivant 將繼續專註其獨特的業務模式——從其它大型葯企放棄的研發項目中尋找最具前景的藥物。

參考：https://www.technologyreview.com/the-download/608595/softbank-is-investing-11-billion-to-help-a-biotech-firms-tech-drive/

[十一郎淺談] 談 Roviant這家公司之前，先看它的CEO， Vivek Ramaswamy，哈佛高材生，在大學期間曾創辦過溢價幫助學生創業的公司StudentBusiness.com，並成功將其賣掉。畢業后加入QVTFinancial，成為DanieGold的對沖基金團隊一員，參與管理生物醫藥投資。兩年前29歲時將自己創立不足一年的公司Axovant Sciences送上納斯達克上市，7名員工，在沒有任何收入情況下估值30億。它做什麼？在2014年12月，公司成立兩個月內，花500萬美元買了葛蘭素史克的一個已經停止臨床試驗、用於治療阿爾茲海默症的葯，重新研發。而上述新聞中Roivant Science正是Axovant Sciences的一家「空殼」母公司，主要通過旗下子公司開發藥物，比如Myovant開發子宮內膜異位和子宮肌瘤藥物，Urovant開發失禁和膀胱過度活動症藥物，Axovant開發痴獃和阿爾茲海默症藥物。這些藥物都來自其他公司拋棄的計劃，然後通過快速測試實現商業化。其中一些藥物已經進入三期臨床試驗，更多藥物處在二期臨床試驗階段。無論怎麼樣，世界終究是屬於年輕人的。

11、EDGC與基蛋生物簽署了戰略合作夥伴協議

Eone-Diagnomic（EDGC）與基蛋生物簽署了戰略合作夥伴協議，這兩家分別位於韓國和的公司都希望最終能開發和拓展亞洲的面向臨床和消費者的基因組市場。EDGC是位於美國加州的生物信息學公司Diagnomics與韓國Eone 生命科學研究所的合資企業。GPBio公司則與復旦大學、北京大學和清華大學均有合作。

參考：https://www.genomeweb.com/sequencing/eone-diagnomics-gpbio-partner-expand-genomic-data-asian-populations

[十一郎淺談] GPBio即基蛋生物，2002年成立，從事體外診斷試劑和醫療器械的研發、生產、銷售。上個月剛剛在A股上市。EDGC是位數不多的美韓合資生命科學企業，提供個人基因組測序和分析。兩者的結合，是否能夠像奕真生物一樣形成生態鏈，還是如Seven Bridges在落地委婉曲折，請讀者拭目以待。

12、Kite即將開啟新葯KITE-585的臨床試驗

Kite Pharma宣布，美國FDA已經批准了其CAR-T療法KITE-585的IND申請，KITE-585計劃用於多發性骨髓瘤的治療，將於近期啟動1期臨床試驗。 KITE-585是一種靶向B細胞成熟抗原（BCMA）的嵌合抗原受體T細胞（CAR-T）治療藥物。

【十一郎淺談】免疫治療本質上市區別於傳統的放療和化療，是增強免疫細泡，而不是像放療化療眉毛鬍子一把抓，而也不僅僅局限於基因檢測對點的檢測，未來會有更多的結合，比如基因編輯。

13、Thermo Fisher公開發行15億美元普通股

Thermo Fisher昨日宣布已開始了其15億美元普通股的包銷公開發行，將使用發行所得款項來分擔其72億美元收購臨床試驗藥物生產商Patheon的一部分費用，包括償還Thermo Fisher承擔的Patheon債務。

參考：https://www.genomeweb.com/business-news/thermo-fisher-commences-15b-public-offering

【十一郎淺談】Thermo Fisher 是今年5月簽下這個史上第二大收購協議（第一大為2013年以136億美元的價格收購Life Technologies）。因為本次收購將三季度末完成，可能由於時間的壓力而採取這樣的方式。

記者/行業分析師/互聯網產品運營/BD （深圳）

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